地球上，一辆火车突然遭到外星生物入侵，整个列车都陷入瘫。关键时刻，一位神秘女子从天而降，及时阻止了正在跟踪人类猎物的外星猎人！而这位神秘的女人其实就是经过重生忘记了身份的第十三任神秘博士，也是《神秘博士》有史以来第一位女博士！随着英国谢菲尔德的人类受到威胁，博士招募了三个新朋友——性格温和的瑞安、做事一丝不苟的小雅以及瑞安的继祖父格雷厄姆。他们一起对抗邪恶的外星人、把被卷入太空的人类平安带回地球、阻止时空秩序被扰乱和破坏、在树林中追赶狡猾的邪恶生物……在共同经历了这一段充满活力、激情和刺激的冒险旅程后，四个人之间的关系感觉不再像同伴那么简单，反而更像是一家人。第十三任博士也在她们的帮助下，终于找回了自己的身份和记忆。