随着彼得·卡帕尔蒂成为掌管蓝色盒子的第十二任博士，全新的神秘博士重生了，他开始控制时间机。博士也必须适应他重生后的新特征和新性格，博士的朋友们也需要时间来适应这位新博士与众不同的风格。神秘的杀手开始在这座都市中秘密行动，一家屠宰场餐馆和一艘被掩埋的宇宙飞船将博士引向一个久违的敌人。在这一季中，博士和他的朋友克莱拉进行了很多奇幻的旅程，他们在试图拯救一艘载着人类幸存者的搁浅飞船时见到了一支戴立克舰队；他们还需要应对在地球上秘密行动的赛博人；他们在和杀手机器人打斗时回到了罗宾汉时代……博士和他的朋友们在时间、空间中探索悠游，打击邪恶力量，拯救文明，帮助不同种族的生物，纠正一些重大的错误，解决五花八门的时空问题。